С такой ситуацией сталкивались те,кто автоматизировал торговые предприятия имеющие удаленные торговые точки или склады с которыми нельзя установить высокоскоростную связь для работы с общей базой,либо связано с "особенностями" деятельности.

Нами разработаны способы решения этой проблемы :
1 способ
Создаете новый журнал импорта данных в котором уникальный индекс будет составной (IDL + дата + КодФилиала(точки))
где IDL не имеет автоматической генерации
А первичный по ID .Остальные поля как и в импортируемом журнале.

...если реализована технология связей,которая далее переносит данные в основной журнал.
ЖурналОбвязки - связка- ТребуемыйЖурнал - полное соответствие полей,кроме ID (он автоматический).

Технология связи по ID источник- ID приемник обеспечит уникальность и искючение дублирования данных при автопереносе.

П.П.При импорте всегда можно контролировать по ключам наличие индекса  через НАЙТИ.

2 способ  уже описывался - при копировании использовать обработчик
ФУНКЦИЯ ЖУРНАЛ(б_кнДвМат) ЛОГИКА: ПередВставкой
// Выполняем необходимые действия при вставке записи из буфера обмена
Вкл= ВКЛ_ФИРМЫ
Ок=НЕТ
ЕСЛИ НОВАЯ И ПередВставкой ТО
//СООБЩЕНИЕ("ДА")
ПОПЫТКА
ВКЛ_ФИРМЫ=НЕТ
ЕСЛИ б_кнДвМат.НАЙТИ(ID=СВОЕ.ID) ТО
СВОЕ.ID=ПУСТО

КОНЕЦ_ЕСЛИ
Ок=ДА
ИСКЛЮЧЕНИЕ
Ок=НЕТ
КОНЕЦ_ПОПЫТКИ

ВКЛ_ФИРМЫ=Вкл
КОНЕЦ_ЕСЛИ
// Разрешаем или запрещаем выполнение этого действия
ПередВставкой = Ок
КОНЕЦ_ФУНКЦИИ

П.П.Кому интересны детали,пишите...на форуме www.infop.ru/forum выкладываться описания не будут.